Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms