Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Wdr53Q9DB94 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr53Q9DB94 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr53Q9DB94 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr53Q9DB94 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr53Q9DB94 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr53Q9DB94 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Wdr53Q9DB94 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms