Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smg9Q9DB90 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms