Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms