Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms