Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms