Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms