Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Fip1l1Q9D824 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms