Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chmp4cQ9D7F7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms