Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbe1Q9D6Y9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms