Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc94Q9D6J3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms