Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rab11fip1Q9D620 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rab11fip1Q9D620 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rab11fip1Q9D620 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rab11fip1Q9D620 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rab11fip1Q9D620 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rab11fip1Q9D620 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rab11fip1Q9D620 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11fip1Q9D620 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rab11fip1Q9D620 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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