Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930513O06RikQ9D549 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms