Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Zcchc13Q9D548 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Zcchc13Q9D548 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Zcchc13Q9D548 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Zcchc13Q9D548 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Zcchc13Q9D548 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Zcchc13Q9D548 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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