Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms