Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsig1Q9D2J4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsig1Q9D2J4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms