Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps28Q9D1C8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps28Q9D1C8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps28Q9D1C8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps28Q9D1C8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps28Q9D1C8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vps28Q9D1C8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps28Q9D1C8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms