Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms