Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shmt2Q9CZN7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shmt2Q9CZN7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms