Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Srfbp1Q9CZ91 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srfbp1Q9CZ91 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms