Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mis12Q9CY25 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mis12Q9CY25 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms