Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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