Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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