Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pin4Q9CWW6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms