Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc3Q9CWU5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms