Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ddx28Q9CWT6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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