Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NubplQ9CWD8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms