Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sppl3Q9CUS9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sppl3Q9CUS9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms