Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms