Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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