Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox16Q9CR63 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox16Q9CR63 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox16Q9CR63 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox16Q9CR63 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox16Q9CR63 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox16Q9CR63 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox16Q9CR63 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox16Q9CR63 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox16Q9CR63 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox16Q9CR63 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox16Q9CR63 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox16Q9CR63 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox16Q9CR63 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox16Q9CR63 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox16Q9CR63 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox16Q9CR63 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox16Q9CR63 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms