Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ifitm3Q9CQW9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ifitm3Q9CQW9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Ifitm3Q9CQW9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ifitm3Q9CQW9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ifitm3Q9CQW9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ifitm3Q9CQW9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ifitm3Q9CQW9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ifitm3Q9CQW9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ifitm3Q9CQW9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms