Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM7

Lce3b, Late cornified envelope 3B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3bQ9CQM7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3bQ9CQM7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms