Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms