Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Atp6v0e1Q9CQD8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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