Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpsQ9CQC2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms