Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA3

Sdhb, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhbQ9CQA3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SdhbQ9CQA3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdhbQ9CQA3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms