Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQ90 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQ90 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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