Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms