Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cdh23Q99PF4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cdh23Q99PF4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh23Q99PF4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cdh23Q99PF4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cdh23Q99PF4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cdh23Q99PF4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cdh23Q99PF4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cdh23Q99PF4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cdh23Q99PF4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh23Q99PF4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms