Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

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Length 1,463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rims1Q99NE5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims1Q99NE5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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