Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf6Q99NA9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms