Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms