Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a6dQ99N07 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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