Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms