Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cstf3Q99LI7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms