Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SardhQ99LB7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms