Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nmd3Q99L48 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nmd3Q99L48 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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