Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ciao1Q99KN2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms