Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Def8Q99J78 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms